หนึ่งในปัญหาเชื้อโรคในอากาศที่หลีกเลี่ยงได้ยากและเป็นภัยต่อสุขภาพ อันเป็นสาเหตุทำให้เกิดโรคต่าง ๆ เช่น โรคติดเชื้อทางเดินหายใจ ไข้หวัด ภูมิแพ้ เป็นต้น จึงมีการนำระบบโอโซนเข้ามาใช้ในการฆ่าเชื้อ โดยโอโซนมีสถานะเป็นก๊าซจึงแพร่การกระจายได้ทั่วพื้นที่มากกว่าการฉีดหรือพ่นละอองน้ำ มีคุณสมบัติ ทำปฏิกิริยาออกซิเดชันกับสารอินทรีย์ สารอนินทรีย์ได้เกือบทุกชนิดทั้งในน้ำและในอากาศ มีฤทธิ์ในการฆ่าเชื้อที่รุนแรงและเร็วกว่าคลอรีนถึง 3,125 เท่า สามารถฆ่าเชื้อโรคในอากาศ ทำลาย และยับยั้งการเจริญเติบโต ของเชื้อโรคต่าง ๆ ได้ถึง 99% เช่น เชื้อแบคทีเรีย เชื้อรา และเชื้อไวรัส จะถูกโอโซนเข้าไปทำลายทำให้เชื้อโรคไม่สามารถเจริญเติบโตได้ นอกจากนี้โอโซนยังช่วยขจัดกลิ่นไม่พึงประสงค์ต่าง ๆ ได้อย่างมีประสิทธิภาพและรวดเร็ว หลังทำปฏิกิริยา โอโซนจะแปรสภาพกลับเป็นก๊าซออกซิเจนซึ่งไม่เป็นอันตรายและไม่ส่งผลกระทบใด ๆ ต่อมนุษย์ สัตว์และสิ่งแวดล้อม

จากบทความวิจัยการฆ่าเชื้อโรคในอากาศ พบว่าผลทดสอบการใช้โอโซนฆ่าเชื้อไวรัสที่ลอยในอากาศ (Airborne Virus) โอโซนสามารถกำจัดเชื้อได้ 99% ที่ระยะเวลา 15 นาที (Chun-Chieh Tseng& Chih-Shan Li [2006]) และการใช้โอโซนฆ่าเชื้อไวรัสบริเวณผิววัสดุเรียบ เช่น ไวรัสบนแก้วพลาสติก หรือสแตนเลส ผลการทดลองพบว่า ระยะเวลาการฆ่าเชื้อ (Contact Time)  ที่ความเข้มข้นโอโซน 20 ppm ระยะเวลา 20 นาที สามารถฆ่าเชื้อไวรัสได้ (Hudson [2009])